测序仪仅一千美元 可迅速投入医学实验

科技日报北京12月6日电 （记者房琳琳）在科幻电影《戛塔卡》中，只有当访问者的基因谱与样本文件相匹配时，才能确定其身份安全。据美国科学促进会（AAAS）科技新闻共享平台EurekAlert!日前报道，美国哥伦比亚大学和纽约基因中心研究人员开发出了一种廉价的DNA测序仪，将其和定制软件匹配应用，可让实时DNA验证身份成为现实。

研究团队在最新一期《eLife》杂志上刊文称，这项技术应用广泛，可以识别大规模灾难中的受害者，分析犯罪现场采集的物证，最直接的用途是在癌症实验中识别出错误标记或污染了的细胞系。

以往的基因测序是利用一种信用卡大小的名为MinION的仪器，通过微孔读取核苷酸序列，但因错误率高等因素，多用于研究细菌和病毒，在人类细胞中使用仍受限。

现在，研究人员进一步创新，将造价仅1000美元的MinION与在线人类基因数据密切结合，以接近完美的准确度验证人类和细胞的身份。MinION首先对随机DNA序列排序，从中选择个性化的变体，然后使用贝叶斯算法随机比较变体混合物，与已存其他文件上的遗传图谱中变体比较，通过每次交叉检查，迅速缩小搜索范围。

研究人员报告说，他们利用该方法将一份面部细胞样本与公共数据库DNA.land上的3.1万基因组参考数据对比，对变体进行交叉核对，几分钟之内，就轻松验证出该团队第一作者索菲·查爱杰的身份。团队其他人员和哥伦比亚大学学生在各种基因组学课程中，也以同样的方式进行了初步测序，结果准确可靠。

这种交叉数据重新识别技术称为“MinION素描”，其作为廉价的细胞认证工具，可以最先迅速应用于实验研究。此前科研机构呼吁，因缺乏自行验证细胞系所需的昂贵机器，大多数医学研究人员要么跳过验证，要么送到专门实验室，延迟了重要的发现和治疗，而新技术解决了由此造成的资金浪费问题。

来源:科技日报